Javier Garciadiego Dantan nació en la ciudad de México el 5 de septiembre 1951.
Cursó la licenciatura en Ciencias Políticas en la Universidad Nacional Autónoma de México. Es Maestro en Historia por la Universidad de Chicago y posee dos doctorados: uno en Historia de México, por El Colegio de México, y otro en Historia de América Latina, por la Universidad de Chicago.
Su especialidad es la historia de la Revolución mexicana, sobre todo en sus aspectos político y cultural, y en un corte cronológico que abarca de finales del siglo XIX a mediados del XX.
Ha sido profesor visitante y conferencista en diferentes universidades del extranjero.
Entre sus reconocimientos y distinciones figuran el Premio Salvador Azuela otorgado, en 1994, por el Instituto Nacional de Estudios Históricos de la Revolución Mexicana; el premio “Biografías para leerse”, del Fondo Nacional para la Cultura y las Artes, con la biografía de Manuel Gómez Morín en 1997, la condecoración de la Gran Cruz de la Orden de Isabel la Católica, del gobierno español en 2009, y la Condecoración Cruz de Oficial de la Orden del Mérito de la República Federal de Alemania, de la Embajada de la República Federal de Alemania en 2015. Es miembro del Sistema Nacional de Investigadores (nivel III) y de la Academia Mexicana de la Historia desde 2008, de la Academia Mexicana de la Lengua desde 2013, Miembro de la Junta de Gobierno de la UNAM también desde 2013 y miembro de El Colegio Nacional desde 2015.
Algunas de sus principales publicaciones son: Así fue la Revolución mexicana, en 8 volúmenes (coordinador académico general, 1985-1986), Rudos contra científicos. La Universidad Nacional durante la Revolución mexicana (1996), Porfiristas eminentes (1996), Alfonso Reyes (2002), La Revolución mexicana. Crónicas, documentos, planes y testimonios (2003), Introducción histórica a la Revolución mexicana (2006), Cultura y política en el México posrevolucionario (2006), 1913-1914: De Guadalupe a Teoloyucan (2013), Alfonso Reyes y Carlos Fuentes. Una amistad literaria (2014), Alfonso Reyes. «un hijo menor de la palabra» Antología (2015) y Autores, editoriales, instituciones y libros. Ensayos de historia intelectual (2015).
Ha sido Director del Centro de Estudios Históricos de El Colegio de México, Director General del Instituto Nacional de Estudios Históricos de la Revolución Mexicana y Presidente de El Colegio de México durante el período 2005 – 2015, institución de la que es Profesor-Investigador desde 1991.